Probenkits für Analyse des Darm-Metaboloms .
Unter Metabolom versteht man die Gesamtheit der Metaboliten in einer funktionellen Einheit oder einem Organ, wie z.B. dem Darm.
Die in Stuhlproben vorhandenen Metaboliten repräsentieren letztlich die im Darm ablaufenden biochemischen Prozesse. Es ist anzunehmen, dass die Signaturen aus Metabolom-Profilen zusammenhängen mit der menschliche Gesundheit, dem Wohlbefinden und auch pathologischen Prozessen.
OMNImet®-GUT (ME-200) ist ein All-in-One-System für die einfache Sammlung, Homogenisierung und Stabilisierung fäkaler Proben bei Raumtemperatur.
Hard Facts .
- Einfache Entnahme zu Hause
- Stabilität bei Raumtemperatur für 7 Tage
- Optimiert für metabolomweite Analysen
- Eine Probensammlung für alle metabolomischen Assays
- Sehr hohe Reproduzierbarkeit durch Point-of-Collection Probenhomogenisierung
- Automatisierbar und für Hochdurchsatz geeignet
- Kompatibel mit gängigen Analyseplattformen
Anwendungen .
Kurzkettige Fettsäuren (SCFAs) sind Schlüsselvermittler der mikrobiellen Aktivität im Darm und spielen eine wichtige Rolle bei der Regulierung des Immunsystems, der Aufrechterhaltung der Epithelbarriere des Darms und der Vorbeugung von Erkrankungen wie dem metabolischen Syndrom, entzündlichen Darmerkrankungen und bestimmten Krebsarten.
De Bruin, O. M., Freinkman, E., Breton, H., Evans, A. M., Miller, L. A. D., Nguyen, U., Adam, K.-P., & Doukhanine, E. (2020). OMNImetTM•GUT enables at-home collection and ambient temperature transport of fecal samples for metabolomics. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00066.pdf
Metabolite spielen eine wichtige Rolle in der Kommunikation und Dynamik zwischen dem Mikrobiom des Darms und dem Wirt. Die Metabolomik ist daher ein besonders leistungsfähiges Instrument zur Analyse und Aufklärung der Funktionen des Darmmikrobioms bei Krankheiten wie Übergewicht, Insulinresistenz, Herzkrankheiten oder Parkinson.
Das Kit OMNImet™•GUT ME-200 bietet eine Lösung, um Metabolom-Profile zu stabilisieren ohne nachfolgende Analysen auf LC/MS Plattformen zu stören.
De Bruin, O. M., Freinkman, E., Breton, H., Evans, A. M., Miller, L. A. D., Nguyen, U., Adam, K.-P., & Doukhanine, E. (2020). OMNImetTM•GUT enables at-home collection and ambient temperature transport of fecal samples for metabolomics. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00066.pdf
OMNImet GUT ME-200 .
Produktübersicht .
Eigenschaft | OMNImet GUT (ME-200) |
---|---|
Pro Kit gesammelte Fäkalproben (Median) [1] | 520 ± 101 mg |
Stabilität des Metabolomprofils bei Raumtemperatur [2] | 7 Tage |
Validiert für ungezielte Metabolomforschung [2] | ✔ |
Validiert für die gezielte Quantifizierung von kurzkettigen Fettsäuren (SCFAs) [2] | ✔ |
Bewahrung der Integrität der Metaboliten über einen Gefrier-Auftau-Zyklus [2] | -20ºC bis +30ºC |
Kompatibel mit gängigen analytischen Plattformen | ✔ |
Geeignet für Langzeitlagerung und Biobanking | ✔ |
Barcode für vollständige Rückverfolgbarkeit der Proben (128C) | ✔ |
[2] DNA Genotek, validation done by Metabolon® (OMNImet™•GUT enables at-home collection and ambient temperature transport of fecal samples for metabolomics. PD-WP-00066)
Eigenschaften .
Das OMNImet•GUT ME-200 Kit ermöglicht Spendern die bequeme Entnahme von Stuhlproben in der Privatsphäre ihres Zuhauses. Die Stabilisierungschemie von ME-200 eliminiert logistische Herausforderungen, die üblicherweise mit Metabolomics-Sammelmethoden verbunden sind.
Vorteile .
- Optimiert für metabolomweite Screenings und gezielte Assays (u.a. SCAF)
- Gezielte sowie nicht gezielte metabolomische Assays aus einem Sammelröhrchen möglich
- Normierte Probenprozessierung garantiert hohe Reproduzierbarkeit und effizienten Arbeitsablauf
- Geeignet für automatisierte Hochdurchsatz-Analyseplattformen
- Tube mit Barcode für zuverlässige Rückverfolgung
- Stabilisierungschemie optimiert für Langzeitlagerung und Biobanking
Short-chain fatty acids (SCFAs) sind in OMNImet GUT für mindestens 7 Tage bei Raumtemperatur stabil .
Kurzkettige Fettsäuren (SCFAs) sind Schlüsselvermittler der mikrobiellen Aktivität im Darm und spielen eine wichtige Rolle bei der Regulierung des Immunsystems, der Aufrechterhaltung der Darmepithelbarriere und der Vorbeugung von Erkrankungen wie dem metabolischen Syndrom, entzündlichen Darmerkrankungen und bestimmten Arten von Krebs. Daher haben wir die Leistung von OMNImet-GUT bei der Stabilisierung von SCFAs bei Raumtemperatur untersucht. Zu diesem Zweck wurde eine gepoolte Stuhlprobe von 7 Spendern bei Raumtemperatur für unterschiedlich lange Zeit in OMNImet-GUT und in einem nicht stabilisierten Zustand (Kryoflasche) gelagert, gefolgt von einer gezielten, quantitativen Analyse von acht SCFAs.
Aliquote einer gepoolten Rohstuhlprobe von 7 Spendern wurden entweder unstabilisiert belassen (n=4 Replikate) oder in OMNImet-GUT (ME-200) (n=4 Wiederholungen, A/B/C/D) bei Raumtemperatur für die angegebene Anzahl von Tagen (T0 bis T13) gelagert, gefolgt von Quantifizierung von acht kurzkettigen Fettsäuren (SCFAs) mittels gezielter LC-MS/MS.
Aus: De Bruin, O. M., Freinkman, E., Breton, H., Evans, A. M., Miller, L. A. D., Nguyen, U., Adam, K.-P., & Doukhanine, E. (2020). OMNImetTM•GUT enables at-home collection and ambient temperature transport of fecal samples for metabolomics. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00066.pdf
Genaue Messung einzelner Metaboliten und Stoffwechselwege .
OMNImet-GUT bewahrt die überwiegende Mehrheit der Metaboliten in frischen Stuhlproben mit hoher Zuverlässigkeit und Stabilität.
Korrelationsanalyse über n=7 biologische Replikate (nach Durchschnittsbildung der n=3 technischen Replikate jedes Spenders) in jeder OMNImet-GUT Lagerungsbedingung (Baseline(T0), Raumtemperatur für 1, 4 oder 7 Tage (T1, T4, T7) oder Gefrier-Auftau Zyklen) im Vergleich zu Flash-Frozen (FF). Der mediane Spearman-Koeffizient für jede Hauptklasse von Biochemikalien (Stoffwechsel-Superpfad) ist aufgetragen und die Anzahl der Biochemikalien in jedem Superpfad (nachgewiesen in tiefgefrorenen Proben) ist markiert.
Aus: De Bruin, O. M., Freinkman, E., Breton, H., Evans, A. M., Miller, L. A. D., Nguyen, U., Adam, K.-P., & Doukhanine, E. (2020). OMNImetTM•GUT enables at-home collection and ambient temperature transport of fecal samples for metabolomics. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00066.pdf
Metabolomics and the Microbiome Revolution: Critical Innovations to Unlock Gut Microbial Function in Human Health .
Héloïse Breton, Ph.D. | Product Manager, Microbiome, DNA Genotek
Lisa Freinkman, Ph.D. | Staff Scientist, Metabolon
Special Guest:
Suchitra Hourigan, MD | Vice Chair of Research, Inova Children’s Hospital
Thomas Schmidt, Ph.D | Professor, University of Michigan
In diesem Webinar werden wir untersuchen, wie die Metabolomik ein entscheidendes Verständnis der Funktion des Darmmikrobioms in vivo ermöglicht und wie die jüngsten technischen Innovationen dazu beitragen, die Anforderungen an die Kühlkette und andere Herausforderungen im Zusammenhang mit der Sammlung, der Lagerung und dem Transport von menschlichen fäkalen Metabolom-Proben zu überwinden. Nehmen Sie an dieser dynamischen Podiumsdiskussion teil, bei der unsere Referenten ihre Erfahrungen zu folgenden Themen austauschen werden:
- Neuartige und umsetzbare funktionelle Erkenntnisse in der Mikrobiomforschung
- Neue bahnbrechende Technologie für die Heimsammlung von menschlichen Stuhlproben für die Metabolomik
- Fallstudien aus der Praxis zur Metabolomik in der klinischen Mikrobiomforschung