Stuhlproben für Mikrobiom-Analysen .
Die OMNIgene®-GUT Kits OM-200 und OMR-205 erfüllen alle Voraussetzungen für beste Probenqualität und ein realitätsnahes Mikrobiomprofil: Die Probennahme selbst ist einfach und sauber, perfekt für Eigenbeprobung durch Patienten oder Studienteilnehmer. Die Stuhlprobe wird im Röhrchen sofort homogenisiert, die Konservierungslösung stabilisiert Nukleinsäuren sehr effektiv. Diese genetische Momentaufnahme der Mikrobiota bleibt auch ohne Kühlung während Lagerung und Transport längere Zeit erhalten.
Hard Facts .
- Intuitive und benutzerfreundliche Probengewinnung
- Minimierung von mikrobiellem Wachstum
- Minimierung von DNA- und RNA-Degradation
- Stabilisierung der DNA und RNA bei Temperaturschwankungen (-20°C bis 50°C)
- Sehr gute Signal-To-Noise Ratio in nachfolgenden Datenanalysen
Anwendungen .
Zur Minimierung der Verfälschung des Darm-Mikrobioms ist eine perfekte Probenhomogenisierung und -stabilisierung notwendig. Aus den gewonnenen Proben können verschiedenste Mikroben zuverlässig über Downstream-Applikationen nachgewiesen werden.
Macklaim, J., Tayeb, M., Dillane, C., Fragel, C., & Cunningham, L. (2021). The need for stabilization: Short-term variation in microbiome profiles. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00070.pdf
Doukhanine, E., Bouevitch, A., Pozza, L., & Merino, C. (2014). OMNIgene®•GUT enables reliable collection of high quality fecal samples for gut microbiome studies. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00040.pdf
Doukhanine, E., Bouevitch, A., Brown, A., Gage LaVecchia, J., Merino, C., & Pozza, L. (2016). OMNIgene®•GUT stabilizes the microbiome profile at ambient temperature for 60 days and during transport. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00042.pdf
Brown, A., Lynch, D., Bouevitch, A., & Doukhanine, E. (2018). OMNIgene®•GUT provides easy self-collection and stabilization of liquid fecal samples for microbiome profiling. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00056.pdf
Tayeb, M., Macklaim, J., Colemeco, S., Fragel, C., Dillane, C., & Cunningham, L. (2020). Impact of fecal collection methods on sample homogenization and extraction reproducibility in gut microbiome profiling. DNA Genotek. https://www.dnagenotek.com/ROW/pdf/PD-WP-00064.pdf
16S rRNA-Analysen ermöglichen die Detektion, Identifizierung und Charakterisierung der Mikroorganismen des Darmmikrobioms.
Anderson, E. L., Li, W., Klitgord, N., Highlander, S. K., Dayrit, M., Seguritan, V., Yooseph, S., Biggs, W., Venter, J. C., Nelson, K. E., & Jones, M. B. (2016). A robust ambient temperature collection and stabilization strategy: Enabling worldwide functional studies of the human microbiome. Scientific Reports, 6(1), 31731. https://doi.org/10.1038/srep31731
Choo, J. M., Leong, L. E., & Rogers, G. B. (2015). Sample storage conditions significantly influence faecal microbiome profiles. Scientific Reports, 5(1), 16350. https://doi.org/10.1038/srep16350
Das humane Darm-Mikrobiom rückt immer mehr in den Fokus der Forschung. Es mehren sich die Hinweise, dass das Mikrobiom in vielen physiologischen, pharmakokinetischen und pathologischen Prozessen eine ausschlaggebende Rolle spielt.
Abrahamson, M., Hooker, E., Ajami, N. J., Petrosino, J. F., & Orwoll, E. S. (2017). Successful collection of stool samples for microbiome analyses from a large community-based population of elderly men. Contemporary Clinical Trials Communications, 7, 158–162. https://doi.org/10.1016/j.conctc.2017.07.002
OMNIgene GUT Mikrobiom Kits .
Produktübersicht .
| Eigenschaft | OM-200 | OMR-205 |
|---|---|---|
| Abnahmestelle | Stuhl | Stuhl |
| Homogenisierung von Proben | ✔ | ✔ |
| Mikrobielle Nukleinsäuren | DNA | DNA und RNA |
| Entnommene Probe pro Kit (Median) | 520 ± 101 mg | 545 mg |
| Versand bei Umgebungstemperatur | ✔ | ✔ |
| Kompatibel mit einer Vielzahl von Nukleinsäureextraktions- und -aufreinigungsverfahren | ✔ | ✔ |
| Standardisiertes Format für die Verarbeitung mit hohem Durchsatz | ✔ | ✔ |
| Anzahl der Extraktionen pro Kit (250 µL pro Extraktion) | 8 | 10 (200 µl pro Extraktion) |
| DNA-Ausbeute pro Extraktion ⌀ (Median) | 12 ± 1,49 µg (12,56 µg) | 4,40 ± 0,52 µg (2,06 µg) |
| DNA mit hohem Molekulargewicht | ✔ | ✔ |
| Stabilität der Mikrobiom-DNA bei Raumtemperatur | 60 Tage | 30 Tage |
| Stabilität der Mikrobiom-RNA bei Raumtemperatur | – | 10 Tage |
| Geeignet für NGS-Downstream-Anwendungen | ✔ | ✔ |
| Geeignet für Langzeitlagerung und Biobanking | ✔ | ✔ |
OMNIgene GUT Kits .
Downloads .
PD-WP-00070: The need for stabilization: Short-term variation in microbiome profiles 0.00 KB
PD-WP-00064: Impact of stool collection methods on sample heterogeneity and extraction reproducibility in gut microbiome profiling 0.00 KB
PD-WP-00056: OMNIgene®•GUT provides easy self-collection and stabilization of liquid fecal samples for microbiome profiling. 0.00 KB
PD-WP-00042: OMNIgene®•GUT stabilizes the microbiome profile at ambient temperature for 60 days and during transport 0.00 KB
PD-WP-00040: OMNIgene®•GUT enables reliable collection of high quality fecal samples for gut microbiome studies 0.00 KB
OMNIgene®•GUT is compatible with the Shoreline complete microbiome prep kit for NGS 0.00 KB