cDNA-Synthese .
Unser primaREVERSE BASIC Reverse Transcription Kit enthält alles, was Sie für die cDNA Synthese aus aufgereinigter Gesamt-RNA benötigen.
Die verwendete proprietäre Reverse Transkriptase mit verminderter RNase-H Aktivität und erhöhter Thermostabillität garantiert eine hohe Spezifität und Ausbeute der cDNA Synthese. Mit Hilfe der mitgelieferten Oligo(dT) und Random Hexamer Primer können Sie das Protokoll sehr einfach entsprechend Ihren Erfordernissen optimieren.
Hard Facts .
- Ready-to-use Komplett-Kit inkl. Primer und DNase
- Geeignet für Templates bis 17 kb
- Hohe Ausbeute durch reduzierte RNase-H Aktivität
- Komplette Reverse Transkription in unter 10 Minuten
- Für spezifische Primer, Random Hexamere oder Oligo(dT) Primer
- Für komplexe Transkripte RT bis 65°C möglich
Anwendungen .
Schnelle und einfache cDNA-Synthese mit nur einem Kit. Das primaREVERSE RT-Kit bietet eine hohe Sensitivität und Spezifität. Zudem ist es sehr flexibel und liefert sowohl mit Oligo(dT) als auch Random Hexameren oder genspezifischen Primern hohe Ausbeuten.
Genexpressionslevels in Geweben oder unterschiedlichen Zelltypen lassen sich über die Detektion von spezifischer mRNA bestimmen. Dazu wird die Gesamt-RNA zuerst in cDNA umgeschrieben. In der nachfolgenden qPCR mit genspezifischen Primern bestimmt man das jeweilige Expressionslevel.
Im Rahmen der Diagnostik von RNA-Viren wird eine Reverse Transcription der Sequenzierung vorgeschaltet, um eine cDNA Library zu erstellen. Neben der Pathogendetektion selbst lassen sich damit auch Mutationsprofile von Pathogenen erstellen.
Als Teil eines RNA-seq Workflows kann die mRNA-Anreicherung mittels Reverser Transkription in Verbindung mit Oligo(dT) Primern durchgeführt werden. Dadurch können sowohl mRNA Selektion und RT in einem Schritt durchgeführt werden, was insbesondere bei geringen RNA Mengen sinnvoll ist. Zu beachten ist, dass hierbei ein 3′-Bias bei der späteren Sequenzierung auftreten kann. Die Folge wäre eine erhöhte Anzahl an Reads für das 3′ Ende der RNAs.
Die Features .
Einfacher Workflow für maximale cDNA Ausbeute .
Mit dem primaREVERSE RT-Kit können Sie RNA in weniger als 15 Minuten in cDNA umschreiben.
Dabei müssen Sie nicht auf Eis pipettieren, da der enthaltene RNase Inhibitor den Abbau der Gesamt-RNA verhindert.
Inhalt .
Inhalt des Kits:
Komponente | Konzentration |
---|---|
10x DNase Incubation Buffer | 10x |
DNase Enzyme Mix | 5 U/µl |
Reverse Transcriptase | 200 U/µl |
5x Reaction Buffer | 5x |
dNTP Mix | 10 mM |
Oligo-(dT)20 Primer | 100 µM |
Random Hexamer Primer | 100 µM |
RNase Inhibitor | 40 U/µl |
RNase-free water | – |
Abpackungen des Kits:
Sensitiv bis zu geringsten RNA Mengen .
Das primaREVERSE Reverse Transcription Kit ermöglicht die cDNA-Synthese selbst aus Proben mit geringsten RNA Mengen.
Von RNA zu cDNA in weniger als 15 Minuten .
Das primaREVERSE RT Kit erlaubt eine Umschreibung von RNA zu cDNA in weniger als 15 Minuten – bei voller Performance.
Mit unserer proprietären Ultra-Fast Reverse Transcriptase lässt sich die cDNA-Synthese sogar auf nur 1 Minute verkürzen, bei nur minimal reduzierter Performance.
Für komplexe Transkripte kann die Reverse Transkription auf bis zu 60 Minuten verlängert werden.
Workflow | DNAse Treatment (optional) | Primer and Template Pre-Incubation | Reverse Transcription | Inactivation | Total Protocol Time |
---|---|---|---|---|---|
Ultra-Fast Workflow without gDNA Removal | – | – | 1 min | 2 min | 3 min |
Fast Workflow without gDNA Removal | – | – | 5 min | 2 min | 7 min |
Recommended Standard Workflow without gDNA Removal | – | – | 10 min | 2 min | 12 min |
Recommended Standard Workflow with gDNA Removal | 5 min | – | 10 min | 2 min | 17 min |
Extended Protocol without gDNA Removal | – | 5 min | 10 min | 2 min | 17 min |
Extended Protocol with gDNA Removal | 5 min | 5min | 10 min | 2 min | 22 min |
Primer inklusive .
- Random Hexamere
- OligoDT(20)
Das primaREVERSE RT-Kit enthält Random Hexamer und OligoDT(20) Primer, so dass Sie die beste Wahl für Ihren Assay treffen können.
In vielen Fällen erzielen Sie mit einer 1:1 Mischung aus Random Hexamer und OligoDT(20) Primer oder Random Hexamer Primern alleine die besten Ergebnisse. In manchen Assays kann es jedoch auch sinnvoll sein, OligoDT(20) Primer zu nutzen, die am Poly-A Tail der mRNA binden.
Auch zur Verwendung Gen-spezifischer Primer ist das primaREVERSE RT-Kit hervorragend geeignet. Details dazu finden Sie im Manual.
Welchen Primer soll ich verwenden ?
Für die meisten Assays empfehlen wir entweder die Verwendung einer 1:1 Mischung aus Random Hexamer und OligoDT(20) Primer oder Random Hexamer Primer alleine.
gDNA Removal für genauere Target-Identifizierung .
Das primaREVERSE RT-Kit enthält einen DNase-Enzym-Mix zur Entfernung von genomischer DNA.
Die Entfernung genomischer DNA aus der Gesamt-RNA empfiehlt sich generell, da selbst Primer, die nicht auf genomischer DNA binden, ein Signal in der qPCR erzeugen können, siehe nachfolgende Abbildung.
Ohne DNase Verdau kann die noch vorhandene genomische DNA ebenfalls ein Signal erzeugen.
Mit einem DNase Verdau wird einer unspezifischen Amplifkation vorgebeugt und das Signal nicht verfälscht.
Abbildung 1:
qPCR Kurvenverlauf für GAPDH mit RNA-spezifischen Primern und einer Inputmenge von 1000 ng Gesamt-RNA. Ohne DNase-Verdau führt die noch in der Probe vorhandene genomische DNA zu einem Amplifikationssignal.
Mit DNase-Verdau kann eine unerwünschte Amplifikation verhindert werden.
Ohne DNase Verdau kann die noch vorhandene
genomische DNA ebenfalls ein Signal erzeugen,
welches eine höhere Genexpression vertäuscht.
Mit einem DNase Verdau
wird einer unspezifischen Amplifkation
vorgebeugt und das Signal nicht verfälscht.
Abbildung 2:
qPCR Ergebnisse (Cq-Werte) mit RNA-spezifischen Primern und einer Inputmenge von 10 ng Gesamt-RNA. Die Reverse Transkription wurde mit OligoDT bzw. Random Hexamer Primern durchgeführt.
Ohne DNase-Verdau wird das qPCR Signal verfälscht. Die Genexpression erscheint höher, als sie tatsächlich ist.
Hohe Effektivität der Reversen Transcriptase selbst bei hohen Temperaturen .
Die veränderte M-MuLV Transkriptase ermöglicht längere RT Läufe bei Temperaturen bis 65°C – perfekt für schwierige Template RNAs.
Made in Germany .
Unsere Enzyme und Master Mixe entwickeln und produzieren wir ausschließlich selbst in Deutschland. Davon profitieren Sie gleich mehrfach:
- Sehr kurze Lieferzeiten
- Schneller und kompetenter Support
- ISO-zertifizierte Produktion
- High-end Qualitätskontrolle
- Kundenspezifische Abfüllungen oder Produktanpassungen
Reverse Transcription Kit .
Downloads .
Komponente | Stock Konzentration | 20 µl Reaktion | Finale Konzentration |
---|---|---|---|
RNA Template | – | 10 μl | Total RNA: 10 pg bis 5 μg je Reaktion |
Aufgereinigte mRNA: 10 pg bis 500 ng je Reaktion | |||
Primer** | 100 µM | 1 µl | 5 µM** ; Gen-spezifischer Primer: 500 nM *** |
5x Reaktionspuffer | 5x | 4 µl | 1x |
dNTP Mix | 10 mM | 1 µl | 500 µM |
RNAse Inhibitor (optional) | 40 U/µl | 0,5 µl | 1 U/µl |
Reverse Transcriptase | 200 U/µl | 1 µl | 10 U/µl |
RNAse freies Wasser | – | auf 20 µl | – |
Inkubation bei 50-55°C für 1-10 min. | |||
Optional: Hitzeinaktivierung bei 95°C für 2 min. |
** either Oligo(dT)20, Random Hexamer or 1:1 mix of Oligo(dT)20 and Random Hexamer Primer
*** For Gene-Specific Primers we recommend to use 500 nM final primer concentration
Primer/RNA Mix
Komponente | Stock Konzentration | 11 µl Primer/RNA Mix | Finale Konzentration |
---|---|---|---|
RNA Template oder Sample aus gDNA Removal Schritt* | – | bis 10 µl | Total RNA: 10 pg bis 5 μg je Reaktion |
Aufgereinigte mRNA: 10 pg bis 500 ng je Reaktion | |||
Primer** | 100 µM | 1 µl | 5 µM**; Gene-Specific Primer: 500 nM*** |
RNAse-freies Wasser | – | auf 11 µl | – |
Primer Annealing: Inkubation bei 70°C für 5 min. |
** either Oligo(dT)20, Random Hexamer or 1:1 mix of Oligo(dT)20 and Random Hexamer Primer
*** For Gene-Specific Primers we recommend to use 500 nM final primer concentration
Final Reaction Mix
Komponente | Stock Konzentration | 9 µl Reaction Mix | Finale Konzentration in Reaktion (20 µl) |
---|---|---|---|
5x Reaktionspuffer | 5x | 4 µl | 1x |
dNTP Mix | 10 mM | 1 µl | 500 µM |
RNase Inhibitor (optional) | 40 U/µl | 0,5 µl | 1 U/µl |
Reverse Transcriptase | 200 U/µl | 1 µl | 10 U/µl |
RNase-freies Wasser | – | auf 9 µl | – |
9 µl des Reaction Mix mit 11 µl Primer/RNA Mix nach Inkubation mischen | |||
Inkubation bei 50-55°C für 1-10 min. | |||
Optional: Hitzeinaktivierung bei 95°C für 2 min. |